Microarray Là Gì

     
Xét nghiệm sinh hóaXét nghiệm huyết họcXét nghiệm máu đông - miễn dịchXét nghiệm thủy dịch - vi sinhXét nghiệm di truyền và SHPT
*

*

*

*

*

Nhóm thiết bị làm cho lạnhNhóm thiết bị làm nóngNhóm thứ cơ họcNội thất phòng thí nghiệmCân/pH/Lọc/Pipet/Bơm...

Bạn đang xem: Microarray là gì


Hóa chất cơ bản/phân tíchHóa hóa học sinh họcSinh phẩm xét nghiệmPipet/Vật bốn tiêu haoHóa hóa học sinh học phân tử
Các chuyên môn phân tíchCác kỹ thuật lấy mẫuPhân một số loại môi trườngCác dự án môi trường xung quanh - chuyển nhượng bàn giao công nghệMôi trường cùng cuộc sống
vincitysdaimo.com

ADN microarray (thông hay được nghe biết với tên gọi ADN cpu hay cpu sinh học) là một tập hợp các điểm ADN siêu nhỏ dại được lắp trên một giá bán thể rắn. Các nhà khoa học sử dụng and microarray nhằm đo một giải pháp đồng thời nút độ biểu hiện của lượng mập gen hoặc các vùng nhiều gen của hệ gen. Từng điểm ADN đựng hàng picomoles (10-12moles) của một trình từ gen đặc hiệu, được nghe biết như các mẫu dò (probes hoặc reporters tốt oligos). Chúng có thể là một quãng ngắn của một ren hoặc một yếu tố ADN khác, được áp dụng để lai với một ADNc hoặc ARNc (hay ARN anti-sense) (được hotline là đích) dưới đk nghiêm ngặt. Sự lai mẫu dò – đích thường xuyên được phát hiện với định lượng bởi những chất khắc ghi huỳnh quang đãng (fluorophore-labeled), bạc tình (silver-labeled) hoặc sự vạc quang bằng phản ứng hóa học (chemiluminescence-labeled) để xác minh mức độ lặp lại của những trình trường đoản cú acid nucleic vào đích.

*

Nguồn ảnh:http://bitesizebio.s3.amazonaws.com/

1. Nguyên lý

Nguyên lý hoạt động mấu chốt của microarray là sự việc lai giữa hai chuỗi ADN, tính năng của trình trường đoản cú acid nucleic là bắt cặp bổ sung cập nhật một bí quyết đặc hiệu với chuỗi sót lại do hình thành link hydro giữa những cặp bazơ nitơ bổ sung. Sau thời điểm rửa các trình tự thêm không đặc hiệu, chỉ bao hàm chuỗi bắt cặp khỏe mạnh sẽ được giữ lại lại. Những trình từ đích được ghi lại huỳnh quang gắn với đầu dò cho tín hiệu phụ thuộc vào đk lai (ví dụ như nhiệt độ) và đk rửa sau lai. Độ mạnh của tín hiệu tại một điểm phụ thuộc vào lượng mẫu đích lắp với đầu dò. Microarray thực hiện định lượng kha khá khi cơ mà cường độ của một điểm đặc thù được so sánh với điểm giống như vậy sinh sống trong điều kiện khác nhau

2. Quy trình

Ứng dụng:

Ứng dụng / Công nghệ

Tóm tắt

Định hình biểu lộ gen (Gene expression profiling)

Trong một phân tách định hình bộc lộ mARN hoặc gen, nút độ biểu thị của hàng ngàn gen được giám sát và đo lường để nghiên cứu và phân tích tác hễ của phương thức điều trị bệnh, tiến triển bệnh và các giai đoạn cải tiến và phát triển nào kia trong biểu hiện gen.Ví dụ: Định hình biểu hiện gen nhờ vào microarray có thể được thực hiện để khẳng định các gen mà biểu thị của nó bị đổi khác dưới tác nhân gây bệnh hay các sinh đồ vật khác bằng phương pháp so sánh biểu lộ gen trong những tế bào hoặc mô bị lây nhiễm với những tế bào hoặc mô không xẩy ra nhiễm.

Phép lai di truyền đối chiếu (Comparative genomic hybridization)

Đánh giá bán hàm lượng cỗ gen trong các tế bào không giống nhau hoặc các sinh vật có quan hệ gần.

Nhận dạng ren (GenID)

Các microarray nhỏ dại được thực hiện để dấn dạng của những sinh vật trong thức ăn cho tất cả những người hoặc động vật hoang dã (giống như GMO: Genetically modified organism: sinh vật biến hóa gen), mycoplasma (vi khuẩn không tồn tại thành tế bào, kích thước nhỏ) trong nuôi ghép tế bào, hoặc tác nhân gây căn bệnh trong chẩn đoán bệnh, hầu hết là phối hợp giữa PCR (polymerase chain reaction) và công nghệ microarray.

Kết tủa miễn dịch chất nhiễm sắc(ChIP: Chromatin immunoprecipitation on Chip)

Các chuỗi ADN thêm với một protein tuyệt nhất định hoàn toàn có thể được phân lập bằng phương pháp kết tủa miễn kháng protein đó. Các mảnh này kế tiếp được lai với một microarray (ví dụ: tiling array- một dạng microarray nhưng các đoạn mồi được sắp xếp chồng chéo) chất nhận được xác xác định trí dính protein ở khắp hệ gen.

Xem thêm: Site Manager Là Gì - Từ Điển Anh Việt Site Manager

Ví dụ: Protein để kết tủa miễn kháng là các dạng biến hóa của histone-histone modifications (H3K27me3, H3K4me2, H3K9me3,…), team protein polycomb- team protein có thể tổ chức lại sợi nhiễm sắc để gia công tắt dt ngoại gene (PRC2: Suz12, PRC1: YY1) cùng nhóm protein trithorax – một tập hợp protein không đồng nhất, hoạt động chính của bọn chúng là gia hạn biểu hiện gene (Ash1) để nghiên cứu và phân tích tổng quan dt ngoại gen (epigenetic landscape) hoặc ARN polymerase II để nghiên cứu và phân tích tổn quan phiên mã.

DamID

Tương từ bỏ với chuyên môn ChIP, những vùng gen links với một protein quan liêu tâm hoàn toàn có thể được phân lập và được sử dụng để gia công đầu dò mang đến kỹ thuật microaray để xác xác định trí liên kết. Không y như ChIP, DamID ko yêu ước kháng thể mà chũm vào kia chúng áp dụng sự methyl hóa adenine ngay sát vị trí dính của protein để khuếch đại một phương pháp chọn lọc các vùng đó.

Phát hiện nhiều hình solo nucleotide (SNP detection)

Đa hình solo nucleotide (single nucleotide polymorphism) ở ở những alen phía bên trong quần thể hoặc các quần thể với nhau. Ứng dụng thường thì của microarray thực hiện trong phát hiện các SNP bao gồm xác định mẫu mã gen, phân tích pháp y, dự đoán thiên hướng về những bệnh (dễ mắc bệnh dịch gì), nhận xét thuốc mới, đánh giá đột thay đổi dòng tế bào sinh dục (germline) của các cá thể hoặc hốt nhiên biến soma vào ung thư, reviews sự mất tính dị vừa lòng tử hoặc phân tích di truyền liên kết.

Phát hiện tại cắt-nối tất cả chọn lọc(AlteARNtive splicing detection)

Một array liên kết với exon (exon junction array design) kiến thiết để áp dụng đầu dò đặc hiệu cho những vị trí cắt-nối tiềm năng của những exon sẽ được dự kiến trước đó đối với một gen. Nó được áp dụng để phân tích biểu thị các dạng cắt-nối của một gen. Những exon array có không ít thiết kế không giống nhau, những đầu dò sử dụng có thiết kế để phát hiện nay từng exon riêng rẽ lẻ cho các gen đang biết hoặc đang được dự đoán trước hoặc hoàn toàn có thể sử dụng nhằm phát hiện các dạng cắt-nối không giống nhau của một protein (isoform).

ADN microarray dung vừa lòng (Fusion gene microarray)

Một ADN microarray dung hợp hoàn toàn có thể phát hiện nay các bạn dạng sao dung đúng theo (fusion transcript – một ARN thể khảm được mã hóa vày một gen phối kết hợp hoặc hai ren khác nhau bằng cách cắt-nối sau phiên mã)ví dụ: từ các mẫu ung thư. Nguyên tắc của nó dựa trên các microarray cắt-nối bao gồm chọn lọc. Chiến lược thiết kế oligo rất có thể kết hợp bài toán đo những kết nối phiên mã thể khảm (chimeric transcript juntions) và đo exon-wise của các đối tượng người dùng kết đúng theo riêng lẻ.

Xem thêm: Hướng Dẫn Cách Chữa Mụn Hạt Com Bằng La Tía To, Cách Chữa Hạt Cơm, Mụn Cóc Đơn Giản Mà Hiệu Quả

Tiling array

Genome tiling array bao hàm các đoạn đầu dò gối lên nhau, được thiết kế cho vùng ren quan tâm, đôi lúc là toàn thể nhiễm sắc thể sống người. Mục tiêu là để phát hiện tại sự biểu lộ phiên mã hoặc việc cắt-nối lựa chọn lọc không biết hoặc không dự kiến được.

kimsa88
cf68